Pakistan leży w strefie klimatów zwrotnikowych na południu i podzwrotnikowych na północy. Klimat jest przeważnie suchy, z dość chłodnymi zimami i upalnymi latami. Ze względu na dużą wysokość zachodnich rejonów kraju, na strefy klimatyczne nakłada się astrefowy klimat górski, w którym temperatura spada wraz z wysokością i wzrasta ilość opadów. W związku z tym powyżej 5000 m przez cały rok leży śnieg i występują lodowce. Na nizinie Indusu klimat jest suchy, z opadami rocznymi 50-100 mm na pustyni Th ar i około 400 mm w Pendżabie. Pora deszczowa przypada na okres od lipca do września i jest związana z monsunem południowo--zachodnim. Na południowym zachodzie kraju opadów można spodziewać się w okresie zimowo-wiosennym. Średnie temperatury powietrza wahają się od 10-16'C zimą do 25-35'C latem.